МШФ работает в режиме дополнительного (платного) образования по дисциплинам, представляющим для учащихся основные проблемы. Составной частью учёбы на факультативе является подготовка к вступительным испытаниям в лицей (в том числе разбираются варианты предыдущих вступительных испытаний).

Учебный план МШФ рассчитан для двух систем с разным количеством часов:

на два семестра (запись — 1-я и 3-я недели сентября);
на один семестр (запись — 2-я неделя января).

Предметы для изучения можно брать в любом наборе (для 9 класса математика+физика идут в комплексе).

Учащиеся занимаются по уникальным методическим разработкам МЭИ и лицея. Цель факультатива — не только дать ученикам образовательную базу для дальнейшего успешного обучения в лицее, но и научить их рационально усваивать материал, ответственно и заинтересованно относиться к обучению и саморазвитию.

Факультативные занятия ведут преподаватели МЭИ и лицея.

На МШФ ведется электронный журнал.
Родители также имеют возможность встречаться с преподавателями после занятий.

В конце 1-го семестра на общем собрании родители знакомятся с итоговой аттестацией и краткой характеристикой ребёнка по каждому предмету. Это дает представление об успеваемости, поведении, отношении к учёбе и т.п. Желающие продолжить обучение получают новый бланк договора и квитанции на оплату любого количества предлагаемых предметов.

Дата набора вновь поступающих на обучение по программе одного семестра (3 месяца) должна быть уточнена дополнительно.
Занятия проходят с середины января до середины апреля.

Учащихся, получившие высокие оценки по итогам аттестации 2-го семестра и при безукоризненном поведении, допускаются к досрочным вступительным испытаниям.

Досрочные испытания проводятся за 2 недели до основных и предоставляют абитуриенту преимущество при поступлении в лицей, так как, ознакомившись с оценками, он имеет возможность пересдать на основном экзамене те предметы, оценка за которые его не удовлетворяет.

Учащиеся МШФ должны соблюдать правила внутреннего распорядка и поведения учащихся.